1、原因：如果养护不当的话，九里香可能会感染病害，比如铁锈病，此病是比较常见的。不仅会导致叶片受害，也会影响到树干，使树干发黑，进而让枝干里面腐朽，甚至会导致植株死亡，危害比较的大。解决方法：做好相应的预防，注意好通风，避免病害发生。如果病害不慎发生后，就需要将患病的枝条、树干剔除，然后喷相应的药剂。
2、原因：感染虫害的话，也有可能导致树干发黑，危害也是比较大的。解决方法：在害虫的数量比较少的时候，可以先进行人工捕捉或自制药剂喷洒，但是一般树干发黑后，说明情况就比较严重了，需要喷施药物进行治疗。
3、原因：九里香生长过程中需要一定的水分，但是如果不根据长势施加，给的水分过多过量的话，就会导致根部积水腐烂，向上蔓延影响到枝干，导致树干发黑。解决方法：控制水分的施加，促进水分尽快蒸发，然后剔除烂掉的根部。