1、含义不同。
（1）知悉的意思是指知晓，旧时多用于上对下的文书、信件。
（2）悉知的意思是全部知道。悉：完全，都，全部；知：明白,了解。
2、用法不同。
（1）知悉表示知道、了解，后面可以不接名词，也可以接名词。如：敬请知悉。
（2）曹禺《北京人》第一幕：她心地慈祥，口里唠叨，知悉曾家事最多，有话就说，曾家上上下下都有些惹她不起。
（3）悉知：表示知道详尽，后面接知道的事情。如：吾已悉知贤弟被害之事。当时即欲斩蔡瑁之首,以献贤弟。出自于《三国演义》。
3、用于现代汉语中有所不同。
（1）知悉：可用于现代汉语公文中，如知悉函是让对方了解知道情况的函件。公文结尾可用“请知悉”。
（2）悉知：一般不用于现代汉语中，多用于古诗文。世有聪慧明达人,具足天眼悉知见。出自《泉州惠安县迎藏经请小参偈》，作者宋代释宗杲。