1、形态区别。枳壳的体积是比较小的。它是酸橙的未成熟干燥果实。它外果皮棕褐色至褐色，果皮表面有颗粒状突起，突起的顶端有凹点状油室。果实表面有明显的花柱残迹或果梗痕。而枳实的体积是比较大的。它是酸橙的接近成熟干燥果实。枳实外果呈皮黑绿色或暗棕绿色。果皮表面同样具有颗粒状突起和皱纹，有明显的花柱残迹或果梗痕。
2、功效区别。中医学上枳壳具有理气宽中，行滞消胀的功效。枳壳的行气能力是比较弱的，性味是温性的。枳壳能够双向调节人体的肠胃。而枳实的性味是寒性的。枳实的行气能力是很强的，它具有破气消积，化痰散痞的功效。
3、使用情况区别。枳壳主要用于调理胸中的气。它对于胸胁气滞，胀满疼痛等临床症状具有很好的缓解。而枳实主要用于调理胸下的气。它对于积滞内停，痞满胀痛，泻痢后重，大便不通，痰滞气阻等更严重的疾病的治疗效果更好。